Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERPINC1P01008 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms