Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCA5LO95447 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms