Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms