Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms