Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC004494.1-201ENST00000613210 2775 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC009078.3-201ENST00000624205 4084 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.4 ms