Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms