Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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