Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
UTP11Q9Y3A2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms