Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms