Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCC13Q9NSE7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms