Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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