Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms