Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABARAPL3Q9BY60 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms