Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms