Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT140Q96RY7 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms