Protein–RNA interactions for Protein: Q96RU2

USP28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP28Q96RU2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP28Q96RU2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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USP28Q96RU2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP28Q96RU2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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