Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms