Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC11Q96DB2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms