Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPBP1Q92547 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms