Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms