Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms