Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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USP43Q70EL4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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USP43Q70EL4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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USP43Q70EL4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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USP43Q70EL4 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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