Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMC5Q6UXY8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMC5Q6UXY8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms