Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms