Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms