Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms