Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3HC1-202ENST00000358303 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KDM8-201ENST00000286096 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms