Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms