Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CNGA3Q16281 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CNGA3Q16281 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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