Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms