Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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