Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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