Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms