Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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GTF2H3Q13889 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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