Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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