Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PMS2P3Q13401 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PMS2P3Q13401 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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PMS2P3Q13401 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PMS2P3Q13401 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PMS2P3Q13401 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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