Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms