Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms