Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms