Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms