Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms