Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms