Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MC1RQ01726 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms