Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX1P83916 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms