Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms