Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms