Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ME1P48163 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ME1P48163 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ME1P48163 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ME1P48163 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ME1P48163 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms