Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms