Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms