Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFE3P19532 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFE3P19532 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms